二戰後，林茂生奉命接收淡水中學、淡水女中、神學院等文教機構，為淡水中學第一任校長，也在臺大校長的邀請下接任臺大文學院代理院長，又受臺灣行政長官公署教育處聘僱任教育甄選委員會委員，可見其之重要性。同時，林茂生亦為《民報》社長，勇於揭露當時政治社會的黑暗，對於權勢當局毫不客氣地加以指責批評，因而得罪當道，埋下厄運的種子。