彰化社頭人，父親蕭明爐是一位鄉間醫生，也是一位虔誠基督徒，蕭朝金幼年家貧，從小就必須打工幫助家計。公學校畢業後沒有升學，後來參加日據時代通信教育（函授），通過高中資格的檢定考試。擁有高中資格後，得以報考台南神學院，3年後畢業，在台南的南門教會擔任傳道師，接著升任牧師，後來轉任高雄岡山教會牧師。日據時代他就追隨林獻堂參加「台灣文化協會」，參與文化演講，抗日民族精神很強。

終戰後，「三民主義青年團」在各地紛紛成立。蕭朝金被推為三青團岡山地區的負責人。他還告訴年團的部屬，要為祖國「打拼」（努力），能回歸祖國真是幸福。但不久，這些年輕人發現這個祖國是個不把台灣人當「同胞」的祖國。

228事件爆發後，青年團的黨員和一批青年佔據岡山教會，當作根據地。當時，蕭朝金還勸年輕人不要輕舉妄動。

3月10日左右，要捉拿蕭牧師的風聲已傳出，有人勸他走避。蕭回答說：「我又沒有做什麼事，何必跑？我是個傳道者，即使他們捉錯人，也是誤會，解釋一下就好。」說話完的半個小時後，士兵來到家中抓走了蕭朝金。4、5天後，他和一位台大學生同時被槍殺在岡山通往大岡山的平交道旁。死後他受到酷刑，鼻子、耳朵都被割掉。蕭朝金的妻子親眼看到丈夫慘不忍睹的遺容。

（摘錄自李筱峰，1990，《二二八消失的台灣菁英》）